Саратони гадуди зери меъда яке аз марговартарин варамҳо дар ҷаҳон аст, ки пешгӯии бад дорад.Аз ин рӯ, модели дақиқи пешгӯӣ барои муайян кардани беморони гирифтори хатари баланди саратони гадуди зери меъда зарур аст, то табобатро мутобиқ созад ва пешгӯии ин беморонро беҳтар созад.
Мо аз пойгоҳи додаи UCSC Xena маълумоти RNAseq adenocarcinoma pancreatic Adenocarcinoma (TCGA) -ро ба даст овардем, тавассути таҳлили коррелятсия lncRNAs (irlncRNAs) алоқамандро муайян кардем ва фарқияти байни TCGA ва бофтаҳои муқаррарии аденокарцинома гадуди зери меъдаро муайян кардем.DEirlncRNA) аз TCGA ва ифодаи бофтаи генотипӣ (GTEx) бофтаи гадуди зери меъда.Барои сохтани моделҳои имзои пешгӯӣ таҳлилҳои минбаъдаи регрессионии яквариат ва лассо анҷом дода шуданд.Сипас, мо майдони зери каҷро ҳисоб кардем ва арзиши оптималии буриданиро барои муайян кардани беморони гирифтори аденокарциномаҳои гадуди зери хатари баланд ва паст муайян кардем.Муқоисаи хусусиятҳои клиникӣ, инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммунӣ, микромуҳити иммуносупрессивӣ ва муқовимат ба химиотерапия дар беморони гирифтори саратони гадуди зери хатари баланд ва паст.
Мо 20 ҷуфти DEirlncRNA-ро муайян кардем ва беморонро мувофиқи арзиши оптималии буридан гурӯҳбандӣ кардем.Мо нишон додем, ки модели имзои пешгӯии мо дар пешгӯии пешгӯии беморони PAAD иҷрои назаррас дорад.AUC каҷи ROC барои пешгӯии 1 сол 0,905, барои пешгӯии 2 сол 0,942 ва барои пешгӯии 3 сол 0,966 аст.Беморони дорои хатари баланд сатҳи зиндамонӣ камтар ва хусусиятҳои клиникии бадтар доштанд.Мо инчунин нишон додем, ки беморони дорои хатари баланд масуният доранд ва метавонанд ба иммунотерапия муқовимат кунанд.Арзёбии доруҳои зидди саратон ба монанди паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб дар асоси асбобҳои пешгӯии ҳисоббарорӣ метавонад барои беморони дорои хатари баланди PAAD мувофиқ бошад.
Дар маҷмӯъ, тадқиқоти мо модели нави хатари пешгӯиро дар асоси irlncRNA-и ҷуфтшуда таъсис дод, ки арзиши пешгӯишавандаро дар беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда нишон дод.Модели пешгӯии хавфи мо метавонад барои фарқ кардани беморони гирифтори PAAD, ки барои табобати тиббӣ мувофиқанд, кӯмак кунад.
Саратони гадуди зери меъда як варами ашаддӣ буда, сатҳи зиндамонии панҷсола паст ва дараҷаи баланд дорад.Ҳангоми ташхис, аксарияти беморон аллакай дар марҳилаи пешрафта қарор доранд.Дар шароити эпидемияи COVID-19, табибон ва ҳамшираҳои шафқат ҳангоми муолиҷаи беморони саратони гадуди зери меъда ва оилаҳои беморон низ ҳангоми қабули қарори табобат ба фишорҳои зиёд дучор мешаванд [1, 2].Гарчанде ки дар табобати DOADs, аз қабили терапияи неоадъювант, резекцияи ҷарроҳӣ, терапияи радиатсионӣ, химиотерапия, терапияи мақсадноки молекулавӣ ва ингибиторҳои назорати иммунӣ (ICIs) дастовардҳои бузург ба даст оварда шудаанд, танҳо тақрибан 9% беморон пас аз панҷ сол пас аз ташхис зинда мемонанд [3] ].], 4].Азбаски нишонаҳои аввали аденокарцинома гадуди зери меъда атипикӣ мебошанд, ба беморон одатан дар марҳилаи пешрафта метастазҳо ташхис карда мешаванд [5].Аз ин рӯ, барои бемори додашуда табобати ҳамаҷонибаи инфиродӣ бояд афзалиятҳо ва нуқсонҳои тамоми имконоти табобатро на танҳо барои дароз кардани зиндамонӣ, балки барои беҳтар кардани сифати зиндагӣ баркашад [6].Аз ин рӯ, модели пешгӯии муассир барои баҳодиҳии дақиқи пешгӯии бемор зарур аст [7].Ҳамин тариқ, табобати мувофиқро метавон барои мувозинати зиндамонӣ ва сифати зиндагии беморони гирифтори PAAD интихоб кард.
Пешгӯии бади PAAD асосан аз муқовимат ба доруҳои химиотерапия вобаста аст.Дар солҳои охир, ингибиторҳои назорати иммунӣ дар табобати варамҳои сахт ба таври васеъ истифода мешаванд [8].Бо вуҷуди ин, истифодаи ICI дар саратони гадуди зери меъда хеле кам муваффақ аст [9].Аз ин рӯ, муайян кардани бемороне, ки метавонанд аз терапияи ICI манфиат гиранд, муҳим аст.
РНК-и дарози коднашаванда (lncRNA) як намуди РНК-и рамзгузоранданашаванда бо транскриптҳо > 200 нуклеотид мебошад.LncRNAs васеъ паҳн шудаанд ва тақрибан 80% транскриптомҳои инсонро ташкил медиҳанд [10].Маҷмӯи зиёди корҳо нишон доданд, ки моделҳои пешгӯии бар асоси lncRNA метавонанд пешгӯии беморро самаранок пешгӯӣ кунанд [11, 12].Масалан, 18 lncRNA-и марбут ба аутофагия барои тавлиди имзоҳои пешгӯӣ дар саратони сина муайян карда шуданд [13].Шаш дигар lncRNA-ҳои марбут ба иммунӣ барои муайян кардани хусусиятҳои пешгӯии глиома истифода шудаанд [14].
Дар саратони гадуди зери меъда, баъзе тадқиқотҳо имзоҳои lncRNA-ро барои пешгӯии пешгӯии бемор муқаррар кардаанд.Имзои 3-lncRNA дар аденокарциномаи гадуди зери меъда бо майдони зери хатти ROC (AUC) ҳамагӣ 0,742 ва зиндамонии умумӣ (OS) 3 сол таъсис дода шудааст [15].Илова бар ин, арзишҳои ифодаи lncRNA дар байни геномҳои гуногун, форматҳои гуногуни додаҳо ва беморони гуногун фарқ мекунанд ва иҷрои модели пешгӯишаванда ноустувор аст.Аз ин рӯ, мо як алгоритми моделсозии нав, ҷуфткунӣ ва итератсияро барои тавлиди имзоҳои марбут ба lncRNA (irlncRNA) барои эҷоди модели пешгӯии дақиқтар ва устувор истифода мебарем [8].
Маълумоти муқарраршудаи RNAseq (FPKM) ва саратони клиникии гадуди зери меъда TCGA ва ифодаи бофтаи генотип (GTEx) аз пойгоҳи додаҳои UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/) гирифта шуданд.Файлҳои GTF аз пойгоҳи додаҳои Ensembl ( http://asia.ensembl.org ) гирифта шуданд ва барои истихроҷи профилҳои ифодаи lncRNA аз RNAseq истифода шуданд.Мо аз пойгоҳи додаҳои ImmPort (http://www.immport.org) генҳои марбут ба масуниятро зеркашӣ кардем ва lncRNA-ҳои марбут ба масуниятро (irlncRNAs) бо истифода аз таҳлили коррелятсия муайян кардем (p <0.001, r> 0.4).Муайян кардани irlncRNAs (DEirlncRNAs) бо роҳи убури irlncRNAs ва lncRNAs ба таври дифференсиалӣ ифодашуда, ки аз пойгоҳи додаҳои GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) дар когорти TCGA-PAAD (|logFC| > 1 ва FDR) гирифта шудаанд. ) <0,05).
Ин усул қаблан гузориш шуда буд [8].Махсусан, мо X-ро барои иваз кардани ҷуфтшудаи lncRNA A ва lncRNA B месозем. Вақте ки арзиши ифодаи lncRNA A аз арзиши ифодаи lncRNA B баландтар аст, X ҳамчун 1 муайян карда мешавад, дар акси ҳол X ҳамчун 0 муайян карда мешавад. Аз ин рӯ, мо метавонем ба даст орем. матритсаи 0 ё – 1. Меҳвари амудии матритса ҳар як намунаро нишон медиҳад ва меҳвари уфуқӣ ҳар як ҷуфти DEirlncRNA-ро бо арзиши 0 ё 1 муаррифӣ мекунад.
Таҳлили регрессияи яктарафа ва пас аз регрессияи Lasso барои скрининги ҷуфтҳои пешгӯии DEirlncRNA истифода шуд.Таҳлили регрессионии лассо 10-каратаи тасдиқи салибро, ки 1000 маротиба такрор шудааст (p <0.05) бо 1000 ангезаҳои тасодуфӣ дар як давидан истифода бурд.Вақте ки басомади ҳар як ҷуфти DEirlncRNA аз 100 маротиба дар 1000 давра зиёд шуд, ҷуфтҳои DEirlncRNA барои сохтани модели хатари пешгӯӣ интихоб карда шуданд.Пас аз он мо каҷи AUC-ро барои дарёфти арзиши оптималии буридан барои тасниф кардани беморони PAAD ба гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст истифода бурд.Арзиши AUC-и ҳар як модел инчунин ҳамчун каҷ ҳисоб карда шуд.Агар каҷ ба нуқтаи баландтарин расад, ки арзиши максималии AUC-ро нишон медиҳад, раванди ҳисобкунӣ қатъ мешавад ва модел беҳтарин номзад ҳисобида мешавад.Моделҳои каҷи ROC-и 1, 3 ва 5-сола сохта шуданд.Таҳлилҳои регрессионии якварианта ва бисёрҷониба барои тафтиши иҷрои мустақили пешгӯии модели хатари пешгӯӣ истифода шуданд.
Барои омӯзиши суръати инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммунӣ ҳафт асбобро истифода баред, аз ҷумла XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS ва CIBERSORT.Маълумоти воридшавии ҳуҷайраҳои иммунӣ аз базаи TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3) бор карда шуданд.Тафовут дар мундариҷаи ҳуҷайраҳои иммунии инфилтратсия байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва пасти модели сохташуда бо истифода аз санҷиши дараҷабандии Wilcoxon таҳлил карда шуд, натиҷаҳо дар графики квадратӣ нишон дода шудаанд.Таҳлили коррелятсияи Спирман барои таҳлили робитаи байни арзишҳои холҳои хавф ва ҳуҷайраҳои инфилтратсияи иммунӣ гузаронида шуд.Коэффисиенти коррелятсияи натиҷавӣ ҳамчун лолипоп нишон дода мешавад.Ҳадди аҳамият дар p <0,05 муқаррар карда шуд.Тартиб бо истифода аз бастаи R ggplot2 анҷом дода шуд.Барои тафтиш кардани робитаи байни модел ва сатҳи ифодаи ген, ки бо суръати инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммунӣ алоқаманд аст, мо бастаи ggstatsplot ва визуализатсияи сюжети скрипкаро иҷро кардем.
Барои арзёбии шакли табобати клиникии саратони гадуди зери меъда, мо IC50-и доруҳои химиотерапияи маъмулан истифодашавандаро дар когорти TCGA-PAAD ҳисоб кардем.Тафовут дар консентратсияи ним inhibitory (IC50) байни гурӯҳҳои хатари баланд ва паст бо истифода аз санҷиши рутбаи имзои Wilcoxon муқоиса карда шуданд, ва натиҷаҳо ҳамчун қуттиҳои тавлидшуда бо истифода аз pRRophetic ва ggplot2 дар R нишон дода шудааст. Ҳама усулҳо ба дастурҳо ва меъёрҳои дахлдор мувофиқат мекунанд.
Ҷараёни кори омӯзиши мо дар расми 1 нишон дода шудааст. Бо истифода аз таҳлили коррелятсия байни lncRNAs ва генҳои ба масуният алоқаманд, мо 724 irlncRNA-ро бо p <0,01 ва r> 0,4 интихоб кардем.Мо минбаъд lncRNA-ҳои ба таври дифференсиалӣ ифодаёфтаи GEPIA2-ро таҳлил кардем (Расми 2А).Ҳамагӣ 223 irlncRNAs байни аденокарциномаҳои гадуди зери меъда ва бофтаи муқаррарии гадуди зери меъда (|logFC | > 1, FDR < 0.05), ки DEirlncRNAs ном доранд, ба таври дифференсиалӣ ифода карда шуданд.
Сохтмони моделҳои пешгӯии хатар.(A) Нақшаи вулқони lncRNA-ҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда.(B) Тақсимоти коэффисиентҳои лассо барои 20 ҷуфтҳои DEirlncRNA.(C) Тафовути қисман эҳтимолияти тақсимоти коэффисиенти LASSO.(D) Қитъаи ҷангал, ки таҳлили яктарафаи регрессионии 20 ҷуфти DEirlncRNA-ро нишон медиҳад.
Мо минбаъд бо ҷуфт кардани 223 DEirlncRNA матритсаи 0 ё 1 сохтем.Ҳамагӣ 13,687 ҷуфтҳои DEirlncRNA муайян карда шуданд.Пас аз таҳлили регрессияи яквариантӣ ва лассо, 20 ҷуфти DEirlncRNA ниҳоят барои сохтани модели хатари пешгӯӣ озмуда шуданд (Расми 2B-D).Дар асоси натиҷаҳои Lasso ва таҳлили регрессионии сершумор, мо барои ҳар як бемор дар гурӯҳи TCGA-PAAD холҳои хавфро ҳисоб кардем (Ҷадвали 1).Дар асоси натиҷаҳои таҳлили регрессияи lasso, мо барои ҳар як бемор дар гурӯҳи TCGA-PAAD холҳои хавфро ҳисоб кардем.AUC-и каҷи ROC барои пешгӯии модели хатари 1-сола 0.905, барои пешгӯии 2-сола 0.942 ва барои пешгӯии 3-сола 0.966 буд (Расми 3A-B).Мо арзиши оптималии буридани 3.105-ро муқаррар кардем, беморони когорти TCGA-PAAD-ро ба гурӯҳҳои хатари баланд ва паст тақсим кардем ва натиҷаҳои зиндамонӣ ва тақсимоти холҳои хавфро барои ҳар як бемор тарҳрезӣ кардем (Расми 3C-E).Таҳлили Каплан-Мейер нишон дод, ки зиндамонии беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд нисбат ба беморони гурӯҳи хавфи паст (p <0.001) ба таври назаррас пасттар буд (Расми 3F).
Эътиборнокии моделҳои хавфи пешгӯӣ.(A) ROC модели хатари пешгӯӣ.(B) Моделҳои хавфи пешгӯии ROC 1-, 2- ва 3-сола.(C) ROC модели хатари пешгӯӣ.Нуқтаи оптималии буришро нишон медиҳад.(DE) Тақсимоти вазъи зиндамонӣ (D) ва холҳои хавф (E).(F) Таҳлили Каплан-Майер беморони PAAD дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст.
Мо минбаъд фарқияти холҳои хавфро аз рӯи хусусиятҳои клиникӣ арзёбӣ кардем.Нақшаи тасма (Расми 4А) муносибати умумии байни хусусиятҳои клиникӣ ва холҳои хавфро нишон медиҳад.Махсусан, беморони калонсол дараҷаи баланди хавф доштанд (Тасвири 4B).Илова бар ин, беморони гирифтори марҳилаи II нисбат ба беморони марҳилаи I дараҷаи хавф баландтар буданд (Тасвири 4C).Дар мавриди дараҷаи варамҳо дар беморони PAAD, беморони дараҷаи 3 нисбат ба беморони дараҷаи 1 ва 2 холҳои хавфи баландтар доштанд (Тасвири 4D).Мо минбаъд таҳлилҳои регрессияи яктарафа ва гуногунҷабҳаро анҷом додем ва нишон додем, ки холҳои хавф (p <0.001) ва синну сол (p = 0.045) дар беморони гирифтори PAAD омилҳои мустақили пешгӯӣ буданд (Тасвири 5A-B).Хатти каҷи ROC нишон дод, ки холҳои хавф аз дигар хусусиятҳои клиникӣ дар пешгӯии зинда мондани 1-, 2- ва 3-солаи беморони гирифтори PAAD (Тасвири 5C-E).
Хусусиятҳои клиникии моделҳои хавфи пешгӯӣ.Гистограмма (A) (B) синну сол, (C) марҳилаи варам, (D) дараҷаи варам, дараҷаи хавф ва ҷинси беморонро дар когорти TCGA-PAAD нишон медиҳад.**p <0,01
Таҳлили мустақили пешгӯии моделҳои хавфи пешгӯӣ.(AB) Таҳлили регрессионии яктарафа (A) ва бисёрҷониба (B) моделҳои хавфи пешгӯӣ ва хусусиятҳои клиникӣ.(CE) 1-, 2- ва 3-солаи ROC барои моделҳои хавфи пешгӯӣ ва хусусиятҳои клиникӣ
Аз ин рӯ, мо муносибати байни вақт ва холҳои хавфро тафтиш кардем.Мо дарёфтем, ки холҳои хавф дар беморони PAAD бо ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK (Тасвири 6А) мутаносибан мутақобила буданд, ки ин нишон медиҳад, ки функсияи фишори иммунӣ дар гурӯҳи хавфи баланд.Мо инчунин фарқияти инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммуниро дар байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст арзёбӣ кардем ва ҳамон натиҷаҳоро ёфтем (Расми 7).Дар гурӯҳи хавфи баланд инфилтратсияи ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK камтар буд.Дар солҳои охир, ингибиторҳои назорати иммунӣ (ICIs) дар табобати варамҳои сахт васеъ истифода мешаванд.Бо вуҷуди ин, истифодаи ICI дар саратони гадуди зери меъда хеле кам муваффақ аст.Аз ин рӯ, мо ифодаи генҳои назорати иммуниро дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст арзёбӣ кардем.Мо дарёфтем, ки CTLA-4 ва CD161 (KLRB1) дар гурӯҳи хавфи паст (Тасвири 6B-G) аз ҳад зиёд ифода карда шудаанд, ки ин нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи паст метавонанд ба ICI ҳассос бошанд.
Таҳлили мутақобилаи модели хатари пешгӯӣ ва инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммунӣ.(A) Таносуби байни модели хавфи пешгӯӣ ва инфилтратсияи ҳуҷайраҳои иммунӣ.(BG) Ифодаи генро дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст нишон медиҳад.(HK) Арзишҳои IC50 барои доруҳои мушаххаси зидди саратон дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст.*p <0,05, **p <0,01, ns = аҳамиятнок нест
Мо минбаъд робитаи байни холҳои хавф ва агентҳои умумии химиотерапияро дар когорти TCGA-PAAD арзёбӣ кардем.Мо доруҳои маъмулан истифодашавандаи зидди саратонро дар саратони гадуди зери меъда ҷустуҷӯ кардем ва фарқияти арзишҳои IC50-и онҳоро байни гурӯҳҳои хатари баланд ва паст таҳлил кардем.Натиҷаҳо нишон доданд, ки арзиши IC50-и AZD.2281 (олапариб) дар гурӯҳи хавфи баланд баландтар буд, ки нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд метавонанд ба табобати AZD.2281 тобовар бошанд (Расми 6H).Илова бар ин, арзишҳои IC50 паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб дар гурӯҳи хатари баланд камтар буданд (Тасвири 6I-K).Мо минбаъд 34 доруи зидди саратонро бо арзишҳои баландтари IC50 дар гурӯҳи хатари баланд ва 34 доруи зидди саратонро бо арзишҳои пасти IC50 дар гурӯҳи хатари баланд муайян кардем (Ҷадвали 2).
Инкор кардан мумкин нест, ки lncRNAs, mRNAs ва miRNAs ба таври васеъ вуҷуд доранд ва дар рушди саратон нақши ҳалкунанда доранд.Далелҳои зиёде мавҷуданд, ки нақши муҳими mRNA ё miRNA дар пешгӯии зиндамонии умумӣ дар якчанд намуди саратонро дастгирӣ мекунанд.Бешубҳа, бисёре аз моделҳои хатари пешгӯӣ низ ба lncRNAs асос ёфтаанд.Масалан, Луо ва дигарон.Таҳқиқот нишон доданд, ки LINC01094 дар паҳншавии компютерҳо ва метастазҳо нақши калидӣ дорад ва ифодаи баланди LINC01094 аз зинда мондани камбизоатии беморони саратони гадуди зери меъда [16].Таҳқиқоте, ки Лин ва дигарон пешниҳод кардааст.Тадқиқотҳо нишон доданд, ки коҳиши танзими lncRNA FLVCR1-AS1 бо пешгӯии бад дар беморони саратони гадуди меъда алоқаманд аст [17].Аммо, lncRNA-ҳои марбут ба масуният дар робита ба пешгӯии зинда мондани умумии беморони саратон нисбатан камтар баррасӣ мешаванд.Ба наздикӣ, миқдори зиёди корҳо ба сохтани моделҳои пешгӯии хатар барои пешгӯии зинда мондани беморони саратон ва ба ин васила танзим кардани усулҳои табобат нигаронида шудааст [18, 19, 20].Эътироф кардани нақши муҳими инфилтратҳои иммунӣ дар оғози саратон, пешравӣ ва вокуниш ба табобатҳо ба монанди химиотерапия.Тадқиқотҳои сершумор тасдиқ карданд, ки ҳуҷайраҳои иммунии инфилтратсияи варам дар вокуниш ба химиотерапияи ситотоксикӣ нақши муҳим мебозанд [21, 22, 23].Микромуҳити иммунии варам омили муҳими зинда мондани беморони варам мебошад [24, 25].Иммунотерапия, махсусан терапияи ICI, дар табобати варамҳои сахт васеъ истифода мешавад [26].Генҳои марбут ба масуният барои сохтани моделҳои хатари пешгӯӣ ба таври васеъ истифода мешаванд.Масалан, Су ва дигарон.Модели пешгӯии хавфи вобаста ба иммунӣ ба генҳои рамзгузори сафеда асос ёфтааст, то пешгӯии беморони саратони тухмдонҳоро пешгӯӣ кунад [27].Генҳои рамзгузорӣнашаванда ба монанди lncRNAs инчунин барои сохтани моделҳои пешгӯии хатар мувофиқанд [28, 29, 30].Луо ва дигарон чаҳор lncRNA-и марбут ба иммуниро озмоиш карданд ва модели пешгӯии хатари саратони гарданаки бачадонро сохтанд [31].Хон ва дигарон.Ҳамагӣ 32 стенограммаҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда муайян карда шуданд ва дар асоси ин модели пешгӯӣ бо 5 транскрипти муҳим таъсис дода шуд, ки он ҳамчун воситаи хеле тавсияшаванда барои пешгӯии радкунии шадиди бо биопсия исботшуда пас аз трансплантатсияи гурда пешниҳод карда шуд [32].
Аксарияти ин моделҳо ба сатҳҳои ифодаи генҳо, ё генҳои рамзгузори сафеда ё генҳои коднашаванда асос ёфтаанд.Аммо, як ген метавонад дар геномҳои гуногун, форматҳои додаҳо ва дар беморони гуногун арзишҳои ифодаи гуногун дошта бошад, ки боиси баҳодиҳии ноустувор дар моделҳои пешгӯӣ мегардад.Дар ин таҳқиқот, мо модели оқилонаеро бо ду ҷуфт lncRNAs, новобаста аз арзишҳои дақиқи ифода сохтем.
Дар ин таҳқиқот, мо бори аввал irlncRNA-ро тавассути таҳлили коррелятсия бо генҳои марбут ба масуният муайян кардем.Мо 223 DEirlncRNA-ро тавассути гибридизатсия бо lncRNA-ҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашуда тафтиш кардем.Дуюм, мо дар асоси усули ҷуфткунии DEirlncRNA нашршуда матритсаи 0 ё-1 сохтем [31].Пас аз он мо барои муайян кардани ҷуфтҳои пешгӯии DEirlncRNA ва сохтани модели пешгӯии хатар таҳлилҳои регрессияи яктарафа ва лассо анҷом додем.Мо минбаъд робитаи байни холҳои хавф ва хусусиятҳои клиникиро дар беморони гирифтори PAAD таҳлил кардем.Мо дарёфтем, ки модели хавфи пешгӯии мо ҳамчун омили мустақили пешгӯишаванда дар беморони PAAD метавонад беморони дараҷаи баландро аз беморони дараҷаи паст ва беморони дараҷаи олиро аз беморони дараҷаи паст фарқ кунад.Илова бар ин, арзишҳои AUC-и каҷи ROC-и модели хатари пешгӯӣ 0,905 барои пешгӯии 1 сол, 0,942 барои пешгӯии 2 сол ва 0,966 барои пешгӯии 3 сол буданд.
Тадқиқотчиён гузориш доданд, ки беморони дорои инфилтратсияи ҳуҷайраҳои CD8+ T ба табобати ICI ҳассостар буданд [33].Афзоиши мундариҷаи ҳуҷайраҳои ситотоксикӣ, ҳуҷайраҳои CD56 NK, ҳуҷайраҳои NK ва CD8+ T дар муҳити иммунии варам метавонад яке аз сабабҳои таъсири супрессивии варам бошад [34].Тадқиқотҳои қаблӣ нишон доданд, ки сатҳи баланди CD4 (+) T ва CD8 (+) T-и варамҳои инфилтратсия бо зинда мондани дарозтар алоқаманд аст [35].Инфилтратсияи сусти ҳуҷайраҳои CD8 T, сарбории пасти неоантиген ва микромуҳити иммуносупрессивии варам боиси набудани вокуниш ба терапияи ICI мегардад [36].Мо дарёфтем, ки холҳои хавф бо ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK алоқамандии манфӣ доранд, ки нишон медиҳад, ки беморони дорои холҳои хавфи баланд метавонанд барои табобати ICI мувофиқ набошанд ва пешгӯии бадтар доранд.
CD161 як аломати ҳуҷайраҳои қотилони табиӣ (NK) мебошад.CD8+CD161+ ҳуҷайраҳои Т, ки тавассути CAR интиқол дода мешаванд, дар моделҳои ксенографти ксенокарцинома дар HER2+ самаранокии зидди варами афзояндаро миёнаравӣ мекунанд [37].Ингибиторҳои нуқтаи назорати иммунӣ протеини цитотоксикии Т-лимфосити алоқаманд 4 (CTLA-4) ва протеини марги ҳуҷайраҳои барномарезишуда 1 (PD-1) / лигандҳои барномарезишудаи марги ҳуҷайра 1 (PD-L1) -ро ҳадаф қарор медиҳанд ва дар бисёр минтақаҳо потенсиали бузург доранд.Ифодаи CTLA-4 ва CD161 (KLRB1) дар гурӯҳҳои хавфи баланд пасттар аст ва минбаъд нишон медиҳад, ки беморони дорои холҳои хавфи баланд метавонанд барои табобати ICI мувофиқ набошанд.[38]
Барои пайдо кардани имконоти муолиҷаи муносиб барои беморони дорои хатари баланд, мо доруҳои гуногуни зидди саратонро таҳлил кардем ва дарёфтем, ки паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб, ки дар беморони гирифтори PAAD васеъ истифода мешаванд, метавонанд барои беморони дорои хатари баланди PAAD мувофиқ бошанд.[33].Чжан ва дигарон муайян карданд, ки мутатсия дар ҳама гуна роҳи ҷавоби зарари ДНК (DDR) метавонад ба пешгӯии бад дар беморони саратони простата оварда расонад [39].Озмоиши саратони гадуди зери меъда Олапариб идома дорад (POLO) нишон дод, ки табобати нигоҳдорӣ бо олапариб дар муқоиса бо плацебо пас аз химиотерапияи дараҷаи аввал дар асоси платина дар беморони гирифтори аденокарциномаҳои рӯдаи гадуди меъда ва мутацияи ҷамоаи BRCA1/2 зиндамонии нигоҳдорӣ бо олапариб дарозтар аст [40].Ин хушбинии назаррасро фароҳам меорад, ки натиҷаҳои табобат дар ин зергурӯҳи беморон ба таври назаррас беҳтар хоҳанд шуд.Дар ин тадқиқот, арзиши IC50-и AZD.2281 (олапариб) дар гурӯҳи хавфи баланд баландтар буд, ки нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд метавонанд ба табобат бо AZD.2281 тобовар бошанд.
Моделҳои пешгӯӣ дар ин таҳқиқот натиҷаҳои пешгӯии хуб медиҳанд, аммо онҳо ба пешгӯиҳои таҳлилӣ асос ёфтаанд.Чӣ тавр тасдиқ кардани ин натиҷаҳо бо маълумоти клиникӣ як саволи муҳим аст.УЗИ-и аспиратсияи сӯзанҳои эндоскопӣ (EUS-FNA) як усули ҳатмӣ барои ташхиси захмҳои сахт ва экстрапанкреатикии гадуди зери меъда бо ҳассосияти 85% ва хусусияти 98% гардид [41].Пайдоиши сӯзанҳои биопсияи сӯзании EUS (EUS-FNB) асосан ба бартариҳои даркшуда нисбат ба FNA асос ёфтааст, ба монанди дақиқии баландтари ташхис, гирифтани намунаҳое, ки сохтори гистологиро нигоҳ медоранд ва ба ин васила тавлиди бофтаи иммунӣ барои ташхисҳои муайян муҳим аст.рангкунии махсус [42].Баррасии мунтазами адабиёт тасдиқ кард, ки сӯзанҳои FNB (хусусан 22G) самаранокии баландтаринро дар ҷамъоварии бофтаҳо аз массаҳои гадуди зери меъда нишон медиҳанд [43].Аз нуқтаи назари клиникӣ, танҳо шумораи ками беморон барои ҷарроҳии радикалӣ ҳуқуқ доранд ва аксари беморон дар вақти ташхиси ибтидоӣ варамҳои ғайрифаъол доранд.Дар амалияи клиникӣ танҳо як қисми ками беморон барои ҷарроҳии радикалӣ мувофиқанд, зеро аксари беморон дар вақти ташхиси ибтидоӣ варамҳои корношоям доранд.Пас аз тасдиқи патологӣ аз ҷониби EUS-FNB ва усулҳои дигар, одатан табобати стандартии ғайриҷарроҳӣ ба монанди химиотерапия интихоб карда мешавад.Барномаи тадқиқоти минбаъдаи мо ин аст, ки модели пешгӯии ин таҳқиқотро дар гурӯҳҳои ҷарроҳӣ ва ғайриҷарроҳӣ тавассути таҳлили ретроспективӣ санҷед.
Дар маҷмӯъ, тадқиқоти мо модели нави хатари пешгӯиро дар асоси irlncRNA-и ҷуфтшуда таъсис дод, ки арзиши пешгӯишавандаро дар беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда нишон дод.Модели пешгӯии хавфи мо метавонад барои фарқ кардани беморони гирифтори PAAD, ки барои табобати тиббӣ мувофиқанд, кӯмак кунад.
Маҷмӯи додаҳои дар таҳқиқоти ҷорӣ истифодашуда ва таҳлилшуда аз муаллифи мувофиқ бо дархости асоснок дастрас мебошанд.
Суй Вен, Гонг X, Чжуан Ю. Нақши миёнаравии худтаъминкунӣ дар танзими эмотсионалии эҳсосоти манфӣ дар давраи пандемияи COVID-19: омӯзиши байнисоҳавӣ.Int J Ment Health Nurs [мақолаи маҷалла].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Суй Вен, Гонг X, Цяо X, Чжан Л, Ченг Ҷ, Донг Ҷ, ва дигарон.Андешаҳои аъзоёни оила дар бораи қабули қарорҳои алтернативӣ дар шӯъбаҳои реаниматсионӣ: баррасии систематикӣ.INT J NURS STUD [мақолаи маҷалла;баррасии].2023 01/01/2023;137:104391.
Винсент А, Ҳерман Ҷ, Шулич Р, Ҳрубан RH, Гоггинс М. Саратони гадуди зери меъда.Лансет.[Мақолаи рӯзнома;дастгирии тадқиқотӣ, NIH, ғоибона;дастгирии тадқиқот, ҳукумат берун аз ИМА;баррасии].2011 08/13/2011;378(9791):607-20.
Ilic M, Ilic I. Эпидемиологияи саратони гадуди зери меъда.Маҷаллаи ҷаҳонии гастроэнтерология.[Мақолаи маҷалла, барраси].2016 28.11.2016;22(44):9694–705.
Лю X, Чен Б, Чен Ҷ, Сан С. Номограммаи нави марбут ба tp53 барои пешгӯии зиндамонии умумӣ дар беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда.BMC Cancer [мақолаи маҷалла].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Таъсири табобати ҳалли нигаронидашуда оид ба хастагии марбут ба саратон дар беморони саратони колоректалӣ, ки химиотерапия мегиранд: озмоиши тасодуфии назоратшаванда.Ҳамшираи саратон.[Мақолаи рӯзнома;озмоиши тасодуфии назоратшаванда;Таҳқиқот аз ҷониби ҳукумат берун аз Иёлоти Муттаҳида дастгирӣ карда мешавад].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Чжан Ченг, Чжэн Вен, Лу Ю, Шан Л, Сю Донг, Пан Ю ва дигарон.Сатҳи антигени карциноэмбрионӣ (CEA) пас аз ҷарроҳӣ оқибати резекцияи саратони рӯдаро дар беморони дорои сатҳи муқаррарии CEA пеш аз ҷарроҳӣ пешгӯӣ мекунад.Маркази тадқиқоти тарҷумаи саратон.[Мақолаи рӯзнома].2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Ҳонг Вен, Лианг Ли, Гу Ю, Ци Зи, Цю Хуа, Янг X ва дигарон.lncRNA-ҳои марбут ба иммунӣ имзоҳои нав тавлид мекунанд ва манзараи иммунии карциномаҳои гепатоцеллярии инсонро пешгӯӣ мекунанд.Мол Ther Кислотаҳои Нуклеинӣ [Мақолаи маҷалла].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Тоффи РҶ, Чжу Ю., Шулич РД Иммунотерапия барои саратони гадуди зери меъда: монеаҳо ва пешрафтҳо.Анн ҷарроҳи меъдаю рӯда [Мақолаи маҷалла;баррасии].2018 07.01.2018;2(4):274–81.
Ҳул Р, Мбита З, Дламини З. РНК-ҳои дарозмуддати рамзгузоришуда (LncRNAs), геномикаи варами вирусӣ ва рӯйдодҳои пайвастагии аберрантӣ: оқибатҳои табобатӣ.AM J CANCER RES [мақолаи маҷалла;баррасии].2021 20.01.2021;11(3):866–83.
Ван Ҷ, Чен П, Чжан Ю, Динг Ҷ, Янг Ю, Ли Ҳ. 11-Муайян кардани имзоҳои lncRNA, ки бо пешгӯии саратони эндометрия алоқаманданд.Дастовардҳои илм [мақолаи маҷалла].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Цзян С, Рен Х, Лю С, Лу З, Сю А, Цин С ва дигарон.Таҳлили ҳамаҷонибаи генҳои пешгӯии протеини РНК ва номзадҳои маводи мухаддир дар карциномаҳои ҳуҷайраҳои гурдаҳои папиллярӣ.преген.[Мақолаи рӯзнома].2021 20.01.2021;12:627508.
Ли X, Чен Ҷ, Ю Ц, Хуан X, Лю З, Ван X, ва дигарон.Хусусиятҳои РНК-и дарозмуддат, ки бо аутофагия алоқаманданд, пешгӯии саратони синаро пешгӯӣ мекунанд.преген.[Мақолаи рӯзнома].2021 20.01.2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Шаш имзои lncRNA бо иммунӣ пешгӯиро дар glioblastoma multiforme беҳтар мекунад.Нейробиологияи MOL.[Мақолаи рӯзнома].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.Имзои нави tri-lncRNA зинда мондани беморони саратони гадуди зери меъдаро пешгӯӣ мекунад.НАМОЯНДАГОНИ ОНКОЛ.[Мақолаи рӯзнома].2018 12.01.2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 ба пешрафти саратони гадуди зери меъда тавассути танзими ифодаи LIN28B ва роҳи PI3K/AKT тавассути исфанҷшудаи miR-577 мусоидат мекунад.Мол Терапевтикҳо - Кислотаҳои нуклеинӣ.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Алоқаи мусбӣ байни lncRNA FLVCR1-AS1 ва KLF10 метавонад пешрафти саратони гадуди зери меъдаро тавассути роҳи PTEN/AKT боздорад.J EXP Clin Res.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Муайян кардани сездаҳ ген, ки зинда мондани умумиро дар карциномаҳои гепатоцеллярӣ пешгӯӣ мекунанд.Biosci Rep [мақолаи маҷалла].2021 04.09.2021.
Вақти фиристодан: сентябр-22-2023