Саратони гадуди зери меъда яке аз марговартарин варамҳо дар ҷаҳон буда, пешгӯии он бад аст. Аз ин рӯ, барои муайян кардани беморони дорои хатари баланди саратони гадуди зери меъда, барои мутобиқ кардани табобат ва беҳтар кардани пешгӯии ин беморон, як модели пешгӯии дақиқ лозим аст.
Мо маълумоти RNAseq Atlas Genome Cancer (TCGA)-и аденокарциномаи гадуди зери меъда (PAAD)-ро аз пойгоҳи додаҳои UCSC Xena ба даст овардем, тавассути таҳлили коррелятсия lncRNA-ҳои марбут ба масуният (irlncRNA)-ро муайян кардем ва фарқиятҳоро байни TCGA ва бофтаҳои аденокарциномаи муқаррарии гадуди зери меъда муайян кардем. DEirlncRNA) аз TCGA ва ифодаи бофтаи генотипӣ (GTEx)-и бофтаи гадуди зери меъда. Барои сохтани моделҳои имзои пешгӯикунанда таҳлилҳои минбаъдаи яквариатӣ ва регрессияи лассо анҷом дода шуданд. Сипас, мо масоҳати зери каҷро ҳисоб кардем ва арзиши буриши оптималиро барои муайян кардани беморон бо аденокарциномаи гадуди зери хатари баланд ва паст муайян кардем. Барои муқоисаи хусусиятҳои клиникӣ, инфилтратсияи ҳуҷайраҳои масуният, микромуҳити иммуносупрессивӣ ва муқовимати химиотерапия дар беморони гирифтори саратони гадуди зери хатари баланд ва паст.
Мо 20 ҷуфт DEirlncRNA-ро муайян кардем ва беморонро мувофиқи арзиши буриши оптималӣ гурӯҳбандӣ кардем. Мо нишон додем, ки модели имзои пешгӯии мо дар пешгӯии пешгӯии беморони гирифтори PAAD самаранокии назаррас дорад. AUC-и каҷи ROC барои пешгӯии 1-сола 0,905, барои пешгӯии 2-сола 0,942 ва барои пешгӯии 3-сола 0,966 аст. Беморони дорои хавфи баланд сатҳи зиндамонии пасттар ва хусусиятҳои клиникии бадтар доштанд. Мо инчунин нишон додем, ки беморони дорои хавфи баланд иммуносупрессия доранд ва метавонанд ба иммунотерапия муқовимат пайдо кунанд. Арзёбии доруҳои зидди саратон, ба монанди паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб, ки бар асоси абзорҳои пешгӯии ҳисоббарорӣ гузаронида шудаанд, метавонад барои беморони дорои хавфи баланд бо PAAD мувофиқ бошад.
Умуман, таҳқиқоти мо модели нави хатари пешгӯиро дар асоси irlncRNA-и ҷуфтшуда муқаррар кард, ки дар беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда арзиши пешгӯии умедбахш нишон дод. Модели хатари пешгӯии мо метавонад ба фарқ кардани беморони гирифтори PAAD, ки барои табобати тиббӣ мувофиқанд, кӯмак кунад.
Саратони гадуди зери меъда як варами бадсифат бо сатҳи пасти зинда мондани панҷсола ва дараҷаи баланд аст. Дар вақти ташхис, аксари беморон аллакай дар марҳилаҳои пешрафта қарор доранд. Дар заминаи эпидемияи COVID-19, табибон ва ҳамшираҳои шафқат ҳангоми табобати беморони гирифтори саратони гадуди зери фишори зиёд қарор доранд ва оилаҳои беморон низ ҳангоми қабули қарорҳои табобат бо фишорҳои зиёд рӯбарӯ мешаванд [1, 2]. Гарчанде ки дар табобати DOADs, ба монанди терапияи неоадъювантӣ, резексияи ҷарроҳӣ, радиотерапия, химиотерапия, терапияи молекулавии мақсаднок ва ингибиторҳои нуқтаи назорати иммунӣ (ICI) пешрафтҳои калон ба даст оварда шудаанд, танҳо тақрибан 9% беморон пас аз ташхис панҷ сол зинда мемонанд [3]. ], 4]. Азбаски нишонаҳои аввали аденокарциномаи гадуди зери меъда атипикӣ мебошанд, беморон одатан дар марҳилаи пешрафта бо метастазҳо ташхис карда мешаванд [5]. Аз ин рӯ, барои як бемори мушаххас, табобати ҳамаҷонибаи инфиродӣ бояд афзалиятҳо ва нуқсонҳои ҳамаи имконоти табобатро на танҳо барои дароз кардани умр, балки барои беҳтар кардани сифати зиндагӣ низ баркашад [6]. Аз ин рӯ, барои арзёбии дақиқи пешгӯии бемор як модели муассири пешгӯи зарур аст [7]. Ҳамин тариқ, табобати мувофиқро барои мувозинат кардани зиндамонӣ ва сифати зиндагии беморони гирифтори PAAD интихоб кардан мумкин аст.
Пешгӯии бади PAAD асосан аз муқовимат ба доруҳои химиотерапия вобаста аст. Дар солҳои охир, ингибиторҳои нуқтаҳои назоратии иммунӣ дар табобати варамҳои сахт ба таври васеъ истифода мешаванд [8]. Аммо, истифодаи ICI дар саратони гадуди зери меъда хеле кам муваффақ аст [9]. Аз ин рӯ, муайян кардани бемороне, ки метавонанд аз терапияи ICI фоида баранд, муҳим аст.
РНК-и дарози ғайрирамзгузор (lncRNA) як навъи РНК-и ғайрирамзгузор бо транскриптҳои >200 нуклеотид мебошад. LncRNA-ҳо васеъ паҳн шудаанд ва тақрибан 80% транскриптомаи инсонро ташкил медиҳанд [10]. Як қатор корҳо нишон доданд, ки моделҳои пешгӯии асосёфта ба lncRNA метавонанд пешгӯии беморро самаранок пешгӯӣ кунанд [11, 12]. Масалан, 18 lncRNA-ҳои марбут ба аутофагия барои тавлиди имзоҳои пешгӯикунанда дар саратони сина муайян карда шуданд [13]. Шаш lncRNA-ҳои дигари марбут ба масуният барои муқаррар кардани хусусиятҳои пешгӯии глиома истифода шудаанд [14].
Дар саратони гадуди зери меъда, баъзе таҳқиқот имзоҳои асоси lncRNA-ро барои пешгӯии пешгӯии бемор муқаррар кардаанд. Дар аденокарциномаи гадуди зери меъда имзои 3-lncRNA бо масоҳати зери каҷи ROC (AUC) танҳо 0,742 ва давомнокии умумии зиндамонӣ (OS) 3 сол муқаррар карда шуд [15]. Илова бар ин, арзишҳои ифодаи lncRNA дар байни геномҳои гуногун, форматҳои гуногуни маълумот ва беморони гуногун фарқ мекунанд ва самаранокии модели пешгӯикунанда ноустувор аст. Аз ин рӯ, мо барои тавлиди имзоҳои lncRNA (irlncRNA)-и марбут ба масуният, барои эҷоди модели пешгӯикунандаи дақиқтар ва устувортар, аз алгоритми нави моделсозӣ, ҷуфткунӣ ва такрор истифода мебарем [8].
Маълумоти RNAseq-и муқарраршуда (FPKM) ва маълумоти клиникии TCGA ва ифодаи бофтаи генотип (GTEx)-и саратони гадуди зери меъда аз пойгоҳи додаҳои UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/) гирифта шуданд. Файлҳои GTF аз пойгоҳи додаҳои Ensembl (http://asia.ensembl.org) гирифта шуданд ва барои истихроҷи профилҳои ифодаи lncRNA аз RNAseq истифода шуданд. Мо генҳои марбут ба масуниятро аз пойгоҳи додаҳои ImmPort (http://www.immport.org) зеркашӣ кардем ва lncRNA-ҳои марбут ба масуниятро (irlncRNA-ҳо) бо истифода аз таҳлили коррелятсия муайян кардем (p <0.001, r > 0.4). Муайян кардани irlncRNA-ҳои дифференсиалӣ (DEirlncRNA-ҳо) тавассути убур кардани irlncRNA-ҳо ва lncRNA-ҳои дифференсиалӣ, ки аз пойгоҳи додаҳои GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) дар когорти TCGA-PAAD (|logFC| > 1 ва FDR) <0.05) гирифта шудаанд.
Ин усул қаблан гузориш шуда буд [8]. Хусусан, мо X-ро барои иваз кардани ҷуфтҳои lncRNA A ва lncRNA B месозем. Вақте ки арзиши ифодаи lncRNA A аз арзиши ифодаи lncRNA B баландтар аст, X ҳамчун 1 муайян карда мешавад, дар акси ҳол X ҳамчун 0 муайян карда мешавад. Аз ин рӯ, мо метавонем матритсаи 0 ё – 1 ба даст орем. Меҳвари амудии матритса ҳар як намунаро ва меҳвари уфуқӣ ҳар як ҷуфти DEirlncRNA-ро бо арзиши 0 ё 1 ифода мекунад.
Таҳлили регрессияи якченакдор ва баъдан регрессияи Лассо барои муайян кардани ҷуфтҳои DEirlncRNA-и пешгӯикунанда истифода шуд. Таҳлили регрессияи лассо аз санҷиши салибии 10-карата, ки 1000 маротиба такрор мешуд (p <0.05), бо 1000 ангезаи тасодуфӣ дар як давр истифода бурд. Вақте ки басомади ҳар як ҷуфти DEirlncRNA дар 1000 давра аз 1000 маротиба зиёд шуд, ҷуфтҳои DEirlncRNA барои сохтани модели хатари пешгӯикунанда интихоб карда шуданд. Сипас, мо аз каҷи AUC барои ёфтани арзиши буриши оптималӣ барои тасниф кардани беморони PAAD ба гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст истифода кардем. Арзиши AUC-и ҳар як модел низ ҳисоб карда шуд ва ҳамчун каҷи каҷ нишон дода шуд. Агар каҷи каҷ ба нуқтаи баландтарине расад, ки арзиши максималии AUC-ро нишон медиҳад, раванди ҳисобкунӣ қатъ мешавад ва модел беҳтарин номзад ҳисобида мешавад. Моделҳои каҷи ROC-и 1, 3 ва 5-сола сохта шуданд. Таҳлилҳои регрессияи якченакдор ва бисёрченакдор барои таҳқиқи иҷрои пешгӯии мустақили модели хатари пешгӯикунанда истифода шуданд.
Барои омӯзиши суръати инфилтратсияи ҳуҷайраҳои масуният аз ҳафт асбоб, аз ҷумла XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS ва CIBERSORT, истифода баред. Маълумот дар бораи инфилтратсияи ҳуҷайраҳои масуният аз пойгоҳи додаҳои TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3) зеркашӣ карда шуданд. Тафовут дар таркиби ҳуҷайраҳои инфилтратсияи масуният байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва пасти модели сохташуда бо истифода аз санҷиши дараҷаи имзошудаи Wilcoxon таҳлил карда шуд, натиҷаҳо дар графики мураббаъ нишон дода шудаанд. Таҳлили коррелятсияи Spearman барои таҳлили робитаи байни арзишҳои холҳои хавф ва ҳуҷайраҳои инфилтратсияи масуният гузаронида шуд. Коэффитсиенти коррелятсияи ҳосилшуда ҳамчун лолипоп нишон дода шудааст. Остонаи аҳамият дар p < 0.05 муқаррар карда шуд. Тартиб бо истифода аз бастаи R ggplot2 анҷом дода шуд. Барои омӯхтани робитаи байни модел ва сатҳҳои ифодаи ген, ки бо суръати инфилтратсияи ҳуҷайраҳои масуният алоқаманданд, мо бастаи ggstatsplot ва графики скрипкаро иҷро кардем.
Барои арзёбии нақшаҳои табобати клиникии саратони гадуди зери меъда, мо IC50-и доруҳои химиотерапияи маъмулан истифодашавандаро дар когорти TCGA-PAAD ҳисоб кардем. Тафовутҳо дар консентратсияҳои ниммонезавӣ (IC50) байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст бо истифода аз санҷиши дараҷаи имзошудаи Wilcoxon муқоиса карда шуданд ва натиҷаҳо ҳамчун нақшаҳои қуттӣ, ки бо истифода аз pRRothetic ва ggplot2 дар R тавлид шудаанд, нишон дода шудаанд. Ҳамаи усулҳо ба дастурҳо ва меъёрҳои дахлдор мувофиқат мекунанд.
Ҷараёни кори таҳқиқоти мо дар расми 1 нишон дода шудааст. Бо истифода аз таҳлили коррелятсия байни lncRNA-ҳо ва генҳои марбут ба масуният, мо 724 irlncRNA-ро бо p <0.01 ва r >0.4 интихоб кардем. Сипас, мо lncRNA-ҳои ба таври дифференсиалӣ ифодашудаи GEPIA2-ро таҳлил кардем (Расми 2A). Дар маҷмӯъ, 223 irlncRNA байни аденокарциномаи гадуди зери меъда ва бофтаи муқаррарии гадуди зери меъда (|logFC| > 1, FDR <0.05), ки DEirlncRNA-ҳо номгузорӣ шудаанд, ба таври дифференсиалӣ ифода карда шуданд.
Сохтани моделҳои пешгӯикунандаи хатар. (A) Графики вулқонии lncRNA-ҳои бо дифференсиалӣ ифодашуда. (B) Тақсимоти коэффитсиентҳои лассо барои 20 ҷуфт DEirlncRNA. (C) Дисперсияи эҳтимолияти қисман дар тақсимоти коэффитсиенти LASSO. (D) Графики ҷангал, ки таҳлили регрессияи якченакаи 20 ҷуфт DEirlncRNA-ро нишон медиҳад.
Баъдан, мо бо ҷуфт кардани 223 DEirlncRNA матритсаи 0 ё 1 сохтем. Дар маҷмӯъ 13,687 ҷуфт DEirlncRNA муайян карда шуданд. Пас аз таҳлили регрессияи якченакдор ва лассо, 20 ҷуфт DEirlncRNA ниҳоят барои сохтани модели хавфи пешгӯикунанда санҷида шуданд (Расми 2B-D). Бар асоси натиҷаҳои таҳлили Лассо ва регрессияи сершумор, мо холҳои хавфро барои ҳар як бемор дар когорти TCGA-PAAD ҳисоб кардем (Ҷадвали 1). Бар асоси натиҷаҳои таҳлили регрессияи лассо, мо холҳои хавфро барои ҳар як бемор дар когорти TCGA-PAAD ҳисоб кардем. AUC-и каҷи ROC барои пешгӯии модели хавфи 1-сола 0,905, барои пешгӯии 2-сола 0,942 ва барои пешгӯии 3-сола 0,966 буд (Расми 3A-B). Мо арзиши буриши оптималии 3.105-ро муқаррар кардем, беморони когорти TCGA-PAAD-ро ба гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст тақсим кардем ва натиҷаҳои зиндамонӣ ва тақсимоти холҳои хатарро барои ҳар як бемор ба нақша гирифтем (Расми 3C-E). Таҳлили Каплан-Мейер нишон дод, ки зиндамонии беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд нисбат ба беморони гурӯҳи хавфи паст ба таври назаррас пасттар буд (p <0.001) (Расми 3F).
Эътибори моделҳои хавфи пешгӯикунанда. (A) ROC-и модели хавфи пешгӯикунанда. (B) Моделҳои хавфи пешгӯикунандаи ROC-и 1, 2 ва 3-сола. (C) ROC-и модели хатари пешгӯикунанда. Нуқтаи буриши оптималиро нишон медиҳад. (DE) Тақсимоти ҳолати зиндамонӣ (D) ва холҳои хатар (E). (F) Таҳлили Каплан-Мейер оид ба беморони PAAD дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст.
Мо минбаъд фарқиятҳои холҳои хавфро аз рӯи хусусиятҳои клиникӣ арзёбӣ кардем. Нақшаи рахӣ (Расми 4A) муносибати умумии байни хусусиятҳои клиникӣ ва холҳои хавфро нишон медиҳад. Хусусан, беморони калонсол холҳои хавфи баландтар доштанд (Расми 4B). Илова бар ин, беморони гирифтори марҳилаи II нисбат ба беморони гирифтори марҳилаи I холҳои хавфи баландтар доштанд (Расми 4C). Дар мавриди дараҷаи варам дар беморони PAAD, беморони дараҷаи 3 нисбат ба беморони дараҷаи 1 ва 2 холҳои хавфи баландтар доштанд (Расми 4D). Мо минбаъд таҳлилҳои регрессияи якченак ва бисёрченакаро анҷом додем ва нишон додем, ки холҳои хавф (p < 0.001) ва синну сол (p = 0.045) омилҳои мустақили пешгӯикунанда дар беморони гирифтори PAAD буданд (Расми 5A-B). Каҷхати ROC нишон дод, ки холҳои хавф нисбат ба дигар хусусиятҳои клиникӣ дар пешгӯии зинда мондани 1, 2 ва 3-солаи беморони гирифтори PAAD бартарӣ доранд (Расми 5C-E).
Хусусиятҳои клиникии моделҳои хавфи пешгӯикунанда. Гистограмма (A) синну сол, (C) марҳилаи варам, (D) дараҷаи варам, холҳои хавф ва ҷинси беморонро дар когорти TCGA-PAAD нишон медиҳад. **p < 0.01
Таҳлили мустақили пешгӯии моделҳои хавфи пешгӯикунанда. (AB) Таҳлили регрессияи якченакаи (A) ва бисёрченакаи (B)-и моделҳои хавфи пешгӯикунанда ва хусусиятҳои клиникӣ. (CE) ROC-и 1-, 2- ва 3-сола барои моделҳои хавфи пешгӯикунанда ва хусусиятҳои клиникӣ.
Аз ин рӯ, мо робитаи байни вақт ва холҳои хавфро таҳқиқ кардем. Мо муайян кардем, ки холҳои хавф дар беморони PAAD бо ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK коррелятсияи баръакс доранд (Расми 6A), ки нишон медиҳад, ки функсияи иммунии пастшуда дар гурӯҳи хавфи баланд аст. Мо инчунин фарқияти воридшавии ҳуҷайраҳои иммуниро байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст арзёбӣ кардем ва натиҷаҳои якхеларо ёфтем (Расми 7). Дар гурӯҳи хавфи баланд воридшавии ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK камтар буд. Дар солҳои охир, ингибиторҳои нуқтаҳои назоратии иммунӣ (ICI) дар табобати варамҳои сахт ба таври васеъ истифода мешаванд. Аммо, истифодаи ICI дар саратони гадуди зери меъда хеле кам муваффақ буд. Аз ин рӯ, мо ифодаи генҳои нуқтаҳои назоратии иммуниро дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст арзёбӣ кардем. Мо муайян кардем, ки CTLA-4 ва CD161 (KLRB1) дар гурӯҳи хавфи паст аз ҳад зиёд ифода ёфтаанд (Расми 6B-G), ки нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи паст метавонанд ба ICI ҳассос бошанд.
Таҳлили коррелятсияи модели хатари пешгӯикунанда ва воридшавии ҳуҷайраҳои масуният. (A) Коррелятсияи байни модели хатари пешгӯикунанда ва воридшавии ҳуҷайраҳои масуният. (BG) Ифодаи генро дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст нишон медиҳад. (HK) Арзишҳои IC50 барои доруҳои мушаххаси зиддисаратонӣ дар гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = назаррас нест
Мо минбаъд робитаи байни холҳои хавф ва агентҳои маъмули химиотерапияро дар когорти TCGA-PAAD арзёбӣ кардем. Мо доруҳои зиддисаратонии маъмулан истифодашавандаро дар саратони гадуди зери меъда ҷустуҷӯ кардем ва фарқиятҳои арзишҳои IC50-и онҳоро байни гурӯҳҳои хавфи баланд ва паст таҳлил кардем. Натиҷаҳо нишон доданд, ки арзиши IC50-и AZD.2281 (олапариб) дар гурӯҳи хавфи баланд баландтар буд, ки нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд метавонанд ба табобати AZD.2281 тобовар бошанд (Расми 6H). Илова бар ин, арзишҳои IC50-и паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб дар гурӯҳи хавфи баланд пасттар буданд (Расми 6I-K). Мо минбаъд 34 доруи зиддисаратониро бо арзишҳои баландтари IC50 дар гурӯҳи хавфи баланд ва 34 доруи зиддисаратониро бо арзишҳои пасттари IC50 дар гурӯҳи хавфи баланд муайян кардем (Ҷадвали 2).
Инкор кардан мумкин нест, ки lncRNA-ҳо, mRNA-ҳо ва miRNA-ҳо ба таври васеъ мавҷуданд ва дар рушди саратон нақши муҳим мебозанд. Далелҳои зиёде мавҷуданд, ки нақши муҳими mRNA ё miRNA-ро дар пешгӯии зинда мондани умумии якчанд намуди саратон дастгирӣ мекунанд. Бешубҳа, бисёр моделҳои хавфи пешгӯикунанда низ ба lncRNA-ҳо асос ёфтаанд. Масалан, Луо ва дигарон. Таҳқиқотҳо нишон доданд, ки LINC01094 дар паҳншавии PC ва метастаз нақши калидӣ мебозад ва ифодаи баланди LINC01094 аз зинда мондани сусти беморони саратони гадуди зери меъда шаҳодат медиҳад [16]. Таҳқиқоте, ки аз ҷониби Лин ва дигарон пешниҳод шудааст. Таҳқиқотҳо нишон доданд, ки паст шудани танзими lncRNA FLVCR1-AS1 бо пешгӯии бад дар беморони саратони гадуди зери меъда алоқаманд аст [17]. Бо вуҷуди ин, lncRNA-ҳои марбут ба масуният аз ҷиҳати пешгӯии зинда мондани умумии беморони саратон нисбатан камтар баррасӣ мешаванд. Ба наздикӣ, миқдори зиёди кор ба сохтани моделҳои хавфи пешгӯикунанда барои пешгӯии зинда мондани беморони саратон ва бо ин васила танзим кардани усулҳои табобат нигаронида шудааст [18, 19, 20]. Эътирофи нақши муҳими инфилтратсияҳои иммунӣ дар пайдоиши саратон, пешрафт ва вокуниш ба табобатҳо ба монанди химиотерапия афзоиш меёбад. Тадқиқотҳои сершумор тасдиқ кардаанд, ки ҳуҷайраҳои иммунии инфилтратсияшавандаи варам дар вокуниш ба химиотерапияи цитотоксикӣ нақши муҳим доранд [21, 22, 23]. Микромуҳити иммунии варам омили муҳим дар зинда мондани беморони варам аст [24, 25]. Иммунотерапия, бахусус терапияи ICI, дар табобати варамҳои сахт ба таври васеъ истифода мешавад [26]. Генҳои марбут ба иммунӣ барои сохтани моделҳои хатари пешгӯикунанда васеъ истифода мешаванд. Масалан, Су ва дигарон. Модели хатари пешгӯикунандаи марбут ба иммунӣ ба генҳои рамзгузори сафеда барои пешгӯии пешгӯии беморони саратони тухмдон асос ёфтааст [27]. Генҳои ғайрирамзгузор, ба монанди lncRNA-ҳо, инчунин барои сохтани моделҳои хатари пешгӯикунанда мувофиқанд [28, 29, 30]. Луо ва дигарон чор lncRNA-ҳои марбут ба иммуниро санҷиданд ва модели пешгӯикунандаи хатари саратони гарданаки бачадонро сохтанд [31]. Хон ва дигарон. Дар маҷмӯъ 32 транскрипти ифодаёфтаи гуногун муайян карда шуданд ва дар асоси он, модели пешгӯии дорои 5 транскрипти муҳим таъсис дода шуд, ки ҳамчун воситаи хеле тавсияшаванда барои пешгӯии радди шадиди пас аз трансплантатсияи гурда, ки бо биопсия тасдиқ шудааст, пешниҳод карда шуд [32].
Аксари ин моделҳо ба сатҳҳои ифодаи генҳо, хоҳ генҳои рамзгузори сафеда ва хоҳ генҳои ғайрирамзгузор, асос ёфтаанд. Аммо, як ген метавонад дар геномҳои гуногун, форматҳои додаҳо ва дар беморони гуногун арзишҳои гуногуни ифода дошта бошад, ки боиси баҳодиҳии ноустувор дар моделҳои пешгӯикунанда мегардад. Дар ин таҳқиқот, мо як модели оқилонаро бо ду ҷуфт lncRNA, ки аз арзишҳои дақиқи ифода новобастаанд, сохтем.
Дар ин таҳқиқот, мо бори аввал irlncRNA-ро тавассути таҳлили коррелятсия бо генҳои марбут ба масуният муайян кардем. Мо 223 DEirlncRNA-ро тавассути гибридизатсия бо lncRNA-ҳои ифодаёфтаи гуногун скрининг кардем. Дуюм, мо матритсаи 0-ё-1-ро дар асоси усули ҷуфткунии DEirlncRNA-и нашршуда [31] сохтем. Сипас, мо таҳлилҳои регрессияи якченакдор ва лассоро барои муайян кардани ҷуфтҳои DEirlncRNA-и пешгӯикунанда ва сохтани модели хавфи пешгӯикунанда анҷом додем. Мо минбаъд робитаи байни холҳои хавф ва хусусиятҳои клиникиро дар беморони гирифтори PAAD таҳлил кардем. Мо муайян кардем, ки модели хавфи пешгӯикунандаи мо, ҳамчун омили мустақили пешгӯикунанда дар беморони PAAD, метавонад беморони дараҷаи баландро аз беморони дараҷаи паст ва беморони дараҷаи баландро аз беморони дараҷаи паст самаранок фарқ кунад. Илова бар ин, арзишҳои AUC-и каҷи ROC-и модели хавфи пешгӯикунанда барои пешгӯии 1-сола 0,905, барои пешгӯии 2-сола 0,942 ва барои пешгӯии 3-сола 0,966 буданд.
Муҳаққиқон гузориш доданд, ки беморони гирифтори инфилтратсияи баланди ҳуҷайраҳои CD8+ T ба табобати ICI ҳассостар буданд [33]. Афзоиши миқдори ҳуҷайраҳои цитотоксикӣ, ҳуҷайраҳои CD56 NK, ҳуҷайраҳои NK ва ҳуҷайраҳои CD8+ T дар микромуҳити иммунии варам метавонад яке аз сабабҳои таъсири пахшкунандаи варам бошад [34]. Тадқиқотҳои қаблӣ нишон доданд, ки сатҳи баланди CD4(+) T ва CD8(+) T, ки ба варам ворид мешаванд, бо давомнокии умри дарозтар алоқамандии назаррас доранд [35]. Инфилтратсияи сусти ҳуҷайраҳои T CD8, бори пасти неоантиген ва микромуҳити иммуносупрессивии баланди варам боиси набудани вокуниш ба терапияи ICI мегардад [36]. Мо муайян кардем, ки холҳои хавф бо ҳуҷайраҳои CD8+ T ва ҳуҷайраҳои NK робитаи манфӣ доранд, ки нишон медиҳад, ки беморони дорои холҳои баланди хавф метавонанд барои табобати ICI мувофиқ набошанд ва пешгӯии бадтар дошта бошанд.
CD161 нишондиҳандаи ҳуҷайраҳои қотили табиӣ (NK) мебошад. Ҳуҷайраҳои Т-и CD8+CD161+, ки бо CAR интиқол дода мешаванд, самаранокии зиддитумори in vivo-ро дар моделҳои ксенотрансплантатсияи аденокарциномаи канали HER2+ таъмин мекунанд [37]. Ингибиторҳои нуқтаҳои назоратии иммунӣ роҳҳои лимфоситҳои ситотоксикии лимфоситҳои алоқаманд бо протеини 4 (CTLA-4) ва протеини барномарезишудаи марги ҳуҷайра 1 (PD-1)/лигандҳои барномарезишудаи марги ҳуҷайра 1 (PD-L1)-ро ҳадаф қарор медиҳанд ва дар бисёр соҳаҳо потенсиали калон доранд. Ифодаи CTLA-4 ва CD161 (KLRB1) дар гурӯҳҳои хавфи баланд пасттар аст, ки ин нишон медиҳад, ки беморони дорои холҳои хавфи баланд метавонанд барои табобати ICI мувофиқ набошанд. [38]
Барои ёфтани вариантҳои табобати мувофиқ барои беморони дорои хатари баланд, мо доруҳои гуногуни зиддисаратонро таҳлил кардем ва муайян кардем, ки паклитаксел, сорафениб ва эрлотиниб, ки дар беморони гирифтори PAAD ба таври васеъ истифода мешаванд, метавонанд барои беморони дорои хатари баланд бо PAAD мувофиқ бошанд. [33]. Чжан ва ҳамкорон муайян карданд, ки мутатсияҳо дар ҳама гуна роҳи вокуниши осеби ДНК (DDR) метавонад дар беморони саратони простата ба пешгӯии бад оварда расонад [39]. Озмоиши саратони гадуди зери меъда Olaparib Ongoing (POLO) нишон дод, ки табобати нигоҳдорӣ бо олапариб зиндамонии бе пешрафтро дар муқоиса бо плацебо пас аз химиотерапияи платинаи сатри аввал дар беморони гирифтори аденокарциномаи дудкальии гадуди зери меъда ва мутатсияҳои BRCA1/2 ҷанинӣ дароз мекунад [40]. Ин умеди назаррасеро фароҳам меорад, ки натиҷаҳои табобат дар ин зергурӯҳи беморон ба таври назаррас беҳтар хоҳанд шуд. Дар ин таҳқиқот, арзиши IC50-и AZD.2281 (олапариб) дар гурӯҳи хавфи баланд баландтар буд, ки нишон медиҳад, ки беморони PAAD дар гурӯҳи хавфи баланд метавонанд ба табобат бо AZD.2281 тобовар бошанд.
Моделҳои пешгӯикунанда дар ин таҳқиқот натиҷаҳои хуби пешгӯиро медиҳанд, аммо онҳо ба пешгӯиҳои таҳлилӣ асос ёфтаанд. Чӣ гуна ин натиҷаҳоро бо маълумоти клиникӣ тасдиқ кардан мумкин аст, як масъалаи муҳим аст. УЗИ аспиратсияи сӯзани борик (EUS-FNA) ба як усули муҳим барои ташхиси захмҳои сахт ва берун аз гадуди зери меъда бо ҳассосияти 85% ва хосияти 98% табдил ёфтааст [41]. Пайдоиши сӯзанҳои биопсияи сӯзани борик (EUS-FNB) асосан ба бартариҳои даркшуда нисбат ба FNA, ба монанди дақиқии баланди ташхисӣ, гирифтани намунаҳое, ки сохтори гистологиро нигоҳ медоранд ва аз ин рӯ тавлиди бофтаи иммунӣ, ки барои ташхисҳои муайян муҳим аст, асос ёфтааст. рангкунии махсус [42]. Баррасии систематикии адабиёт тасдиқ кард, ки сӯзанҳои FNB (хусусан 22G) самаранокии баландтаринро дар ҷамъоварии бофта аз массаҳои гадуди зери меъда нишон медиҳанд [43]. Аз ҷиҳати клиникӣ, танҳо шумораи ками беморон барои ҷарроҳии радикалӣ мувофиқанд ва аксари беморон дар вақти ташхиси аввалия варамҳои ғайрифаъол доранд. Дар амалияи клиникӣ, танҳо як қисми ками беморон барои ҷарроҳии радикалӣ мувофиқанд, зеро аксари беморон дар вақти ташхиси аввалия варамҳои ғайрифаъол доранд. Пас аз тасдиқи патологӣ тавассути EUS-FNB ва дигар усулҳо, одатан табобати стандартии ғайриҷарроҳӣ, ба монанди химиотерапия, интихоб карда мешавад. Барномаи таҳқиқоти минбаъдаи мо озмоиши модели пешгӯии ин тадқиқот дар гурӯҳҳои ҷарроҳӣ ва ғайриҷарроҳӣ тавассути таҳлили ретроспективӣ мебошад.
Умуман, таҳқиқоти мо модели нави хатари пешгӯиро дар асоси irlncRNA-и ҷуфтшуда муқаррар кард, ки дар беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда арзиши пешгӯии умедбахш нишон дод. Модели хатари пешгӯии мо метавонад ба фарқ кардани беморони гирифтори PAAD, ки барои табобати тиббӣ мувофиқанд, кӯмак кунад.
Маҷмӯаҳои маълумоте, ки дар таҳқиқоти ҷорӣ истифода ва таҳлил шудаанд, бо дархости оқилона аз муаллифи мувофиқ дастрасанд.
Суй Вен, Гунг X, Чжуан Ю. Нақши миёнаравии худэътимодӣ дар танзими эмотсионалии эҳсосоти манфӣ дар давраи пандемияи COVID-19: як таҳқиқоти байнисоҳавӣ. Int J Ment Health Nurs [мақолаи маҷалла]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Суй Вен, Гунг X, Цяо X, Чжан Л, Ченг Ҷ, Донг Ҷ ва дигарон. Назари аъзои оила дар бораи қабули қарорҳои алтернативӣ дар шӯъбаҳои эҳёгарӣ: баррасии систематикӣ. INT J NURS STUD [мақолаи маҷалла; баррасӣ]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Винсент А, Ҳерман Ҷ, Шулих Р, Хрубан Р.Ҳ., Гоггинс М. Саратони гадуди зери меъда. Лансет. [Мақолаи маҷалла; дастгирии тадқиқот, NIH, берун аз донишгоҳ; дастгирии тадқиқот, ҳукумат берун аз ИМА; баррасӣ]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Илич М, Илич И. Эпидемиологияи саратони гадуди зери меъда. Маҷаллаи ҷаҳонии гастроэнтерология. [Мақола, баррасии маҷалла]. 2016 28/11/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Номограммаи нави марбут ба tp53 барои пешгӯии зинда мондани умумии беморони гирифтори саратони гадуди зери меъда. Саратони BMC [мақолаи маҷалла]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Сиан X, Жу X, Чен Y, Хуанг B, Сян В. Таъсири терапияи ба ҳалли масъала нигаронидашуда ба хастагии марбут ба саратон дар беморони саратони колоректалӣ, ки химиотерапия мегиранд: як озмоиши тасодуфии назоратшаванда. Ҳамшираи саратон. [Мақолаи маҷалла; озмоиши тасодуфии назоратшаванда; ин тадқиқот аз ҷониби ҳукумати берун аз Иёлоти Муттаҳида дастгирӣ карда мешавад]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Чжан Ченг, Чжэн Вен, Лу Ю, Шан Л, Сюй Донг, Пан Ю ва дигарон. Сатҳи антигени карциноэмбрионии пас аз ҷарроҳӣ (CEA) натиҷаро пас аз резексияи саратони колоректалӣ дар беморони дорои сатҳи муқаррарии CEA пеш аз ҷарроҳӣ пешгӯӣ мекунад. Маркази тадқиқоти саратони транслятсионӣ. [Мақолаи маҷалла]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Ҳонг Вен, Лян Ли, Гу Ю, Ци Зи, Цю Хуа, Янг Икс ва дигарон. lncRNA-ҳои марбут ба масуният имзоҳои нав эҷод мекунанд ва манзараи масунияти карциномаи гепатоселлюлярӣ инсонро пешгӯӣ мекунанд. Кислотаҳои нуклеинии молӣ [Мақолаи маҷалла]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Тоффи РҶ, Жу Ю., Шулих РД Иммунотерапия барои саратони гадуди зери меъда: монеаҳо ва пешрафтҳо. Энн Гастроинтестинал Ҷарроҳ [Мақолаи маҷалла; баррасӣ]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Халл Р., Мбита З., Дламини З. РНК-ҳои дарози ғайрирамзгузор (LncRNAs), геномикаи варами вирусӣ ва рӯйдодҳои пайвастшавии ғайримуқаррарӣ: оқибатҳои терапевтӣ. AM J CANCER RES [мақолаи маҷалла; баррасӣ]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Ванг Ҷ, Чен П, Чжан Й, Динг Ҷ, Ян Й, Ли Х. 11-Муайян кардани имзоҳои lncRNA, ки бо пешгӯии саратони эндометрия алоқаманданд. Дастовардҳои илм [мақолаи маҷалла]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S ва дигарон. Таҳлили ҳамаҷонибаи генҳои пешгӯикунандаи сафедаҳои RNA ва номзадҳои дору дар карциномаи ҳуҷайраҳои гурда бо ҳуҷайраҳои папиллярӣ. pregen. [Мақолаи маҷалла]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Ли Х, Чен Ҷ, Ю К, Хуанг Х, Лю З, Ванг Х ва дигарон. Хусусиятҳои РНК-и дароз ва ғайрирамзгузоришаванда, ки бо аутофагия алоқаманданд, пешгӯии саратони синаро пешгӯӣ мекунанд. pregen. [Мақолаи маҷалла]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Чжоу М, Чжан З, Чжао Х, Бао С, Ченг Л, Сун Ҷ. Шаш имзои lncRNA-и марбут ба масуният пешгӯиро дар глиобластомаи бисёршакл беҳтар мекунад. Нейробиологияи MOL. [Мақолаи маҷалла]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Ву Б, Ванг К, Фей Ҷ, Бао Й, Ванг Х, Сонг З ва дигарон. Имзои нави се-lncRNA зинда мондани беморони гирифтори саратони гадуди зери меъдаро пешгӯӣ мекунад. НАМОЯНДАГОНИ ONKOL. [Мақолаи маҷалла]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Луо С, Лин К, Ху С, Жу Х, Жу Ҷ, Жу З. LINC01094 пешрафти саратони гадуди зери меъдаро тавассути танзими ифодаи LIN28B ва масири PI3K/AKT тавассути miR-577-и исфанҷдор мусоидат мекунад. Mol Therapeutics – кислотаҳои нуклеинӣ. 2021;26:523–35.
Лин Ҷ, Жай Х, Зоу С, Сюй З, Чжан Ҷ, Ҷян Л ва дигарон. Фикру мулоҳизаҳои мусбат байни lncRNA FLVCR1-AS1 ва KLF10 метавонанд пешрафти саратони гадуди зери меъдаро тавассути роҳи PTEN/AKT боздоранд. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Чжоу X, Лю X, Зенг X, Ву Д, Лю Л. Муайян кардани сездаҳ ген, ки зинда мондани умумии карциномаи гепатоселлюлярӣ-ро пешгӯӣ мекунанд. Biosci Rep [мақолаи маҷалла]. 2021 04/09/2021.
Вақти нашр: 22 сентябри соли 2023